ייצוא VCF בלבד
.vcf או .vcf.gz
השירות הזה ממיר רשומות וריאנטים תואמות לטקסט RAW. הכיסוי של המקור, הסינון ואיכות הגנוטיפ עדיין מגבילים את התוצאה.
בדקו את פרטי השירות
המרת VCF ל-RAW / שירות המרת קבצים
הנתונים שכבר יש לכם
הנתונים שכבר יש לכם
בפורמט חדש
העבירו נתוני וריאנטים נתמכים מ-VCF לטקסט RAW לשימוש בכלי מוצא גנטי וגנאלוגיה. הבינו קודם את כיסוי קובץ המקור, ואז בחרו את ההמרה שמתאימה לקובץ.
$24.93שירות חד-פעמי, בלי מנוי.
השירות ממיר פורמט בלבד. הוא אינו מוסיף מדידות גנטיות ואינו מבטיח ששירות אחר יקבל את הקובץ.
בחרו את קובץ המקור המתאים
עדיין יש לכם את קובצי הריצוף המקוריים?
קובץ VCF מסונן עשוי להכיל פחות סמנים שמישים מהמרה שנעשית מהקריאות או מהיישור המקוריים. התחילו בקובץ המתאים ביותר מבין הקבצים הזמינים.
קובץ BAM או CRAM זמין
נתוני ריצוף מקוריים אחרי יישור
בדקו את שירות ההמרה מ-WGS ל-RAW לפני שאתם מזמינים המרה של קובץ VCF ביניים.
למדו על המרת WGS ל-RAWקובץ FASTQ זמין
קריאות ריצוף מקוריות
שירות ההמרה מ-FASTQ ל-RAW מתחיל בקריאות הריצוף, לפני סינון הווריאנטים והייצוא שלהם.
למדו על המרת FASTQ ל-RAWשלבי ההמרה
הכינו את הקובץ, המירו ובדקו את התוצאה
השירות ממיר את פורמט הקובץ. הוא אינו כולל ריצוף חדש, אימפוטציה או קריאת וריאנטים.
הכינו את קובץ ה-VCF
שמרו על הייצוא המקוריהשתמשו בקובץ VCF נתמך, רגיל או דחוס ב-gzip, ושמרו על הכותרת שלו. פעלו לפי הוראות קובץ המקור שמופיעות בהזמנה.
המרת הרשומות השמישות
מגבלות קובץ המקוררשומות הווריאנטים נקראות ומוכנות בפורמט RAW. מטא-נתוני העיבוד, שדות הגנוטיפ והסינון משפיעים על הרשומות שאפשר להשתמש בהן.
בדקו את דרישות הכלי הקולט
לפני שיתוף התוצאהבדקו את הקובץ שהתקבל, את הפורמט, את גרסת הגנום הייחוס ואת כללי ההעלאה שהכלי הקולט קובע. השירות הזה מחליט אם לקבל את הקובץ.
מה תקבלו?פלט ההמרה
פלט ההמרה
ומגבלות השימוש בו
פורמט RAW עשוי לאפשר שימוש בנתונים הנתמכים בכלי אחר. הוא אינו יכול להפוך קובץ וריאנטים חסר לקריאות שמכסות את הגנום כולו.
- טקסט RAW מקובץ המקורהכיסוי תלוי ברשומות הווריאנטים ובמידע הגנוטיפ שנמצאים בקובץ ה-VCF.
- בלי מדידות גנטיות חדשותשינוי פורמט הקובץ אינו משחזר מיקומים חסרים או כאלה שסוננו.
- לכל שירות כללי קבלה משלוחלק מהשירותים מקבלים קובצי RAW שהמשתמשים מספקים, ואחרים דורשים קבצים מהבדיקות שלהם. בדקו את הדרישות לפני ההזמנה.
רכישת השירות
המרה של קובץ אחד
בדקו את קובץ המקור ואת דרישות הכלי שבו תשתמשו לפני הרכישה. מחיר השירות הזמין כעת מופיע למטה.
שירות המרה חד-פעמי
המרת VCF ל-RAW
המירו קובץ VCF נתמך לקובץ טקסט בפורמט RAW לשימוש בכלי מחקר מוצא גנטי וגנאלוגיה תואמים.
$24.93
Your purchase at a glance
- You receive
- A RAW genotype file prepared from usable records in the supplied variant file. RAW text from a supported VCF or VCF.GZ source.
- Covers
- One supported source file for the sample and conversion selected in the order.
- Access
- One-time format conversion; delivered downloads have the availability dates shown in the purchased product.
- You need
- A compatible VCF or VCF.GZ with usable genotype records and preserved header information.
- Not included
- No sequencing, imputation or new variant calling. Filtered-out or omitted source records cannot be restored; acceptance by another website is not guaranteed.
After purchaseFollow the submission instructions attached to the order. Review validation or processing information, then download the available output from the purchased product.
Open your purchases- קלט נתמך בפורמט VCF או VCF.GZ
- פלט RAW שמבוסס על הרשומות השמישות בקובץ המקור
- המרת פורמט הקובץ, בלי אימפוטציה ובלי קריאה של וריאנטים חדשים
פעלו לפי הוראות שליחת הקבצים שמוצגות בהזמנה. בדקו את מידע העיבוד, ההסכמה והשמירה במהלך ההזמנה ובמדיניות הפרטיות. הקבצים המומרים מיועדים למחקר ולחינוך בלבד, ואינם מתאימים לאבחון קליני או להחלטות רפואיות.
לפני ההזמנהאילו קבצים מתקבלים?
אילו קבצים מתקבלים?
ומה אפשר לצפות לקבל?
בדקו מה יש בייצוא ומה הכלי הבא באמת מקבל.
מה כוללת המרת VCF ל-RAW?
השירות ממיר רשומות וריאנטים נתמכות מקובץ VCF או VCF.GZ לטקסט RAW למחקר מוצא גנטי וגנאלוגיה. הוא אינו כולל ריצוף, אימפוטציה או קריאה של וריאנטים חדשים.
האם עדיף להשתמש בקובץ BAM, CRAM או FASTQ המקורי?
אם קובצי הריצוף המקוריים עדיין אצלכם, בדקו קודם את המרת WGS ל-RAW או FASTQ ל-RAW. קובץ VCF מסונן או שמכיל רק וריאנטים עשוי לכלול פחות סמנים שמישים מתהליך שמתחיל בנתוני הריצוף המקוריים.
אילו קובצי VCF אפשר לשלוח?
השירות מקבל ייצואי VCF נתמכים, לא דחוסים או דחוסים ב-gzip. שמרו על כותרת הקובץ ופעלו לפי הוראות ההזמנה. מטא-נתונים של כלי הקריאה, הכיסוי והסינון עשויים להשפיע על ההמרה. סיומת הקובץ לבדה אינה מוכיחה תאימות.
האם קובץ ה-RAW יעבוד בכל אתר לניתוח DNA?
לא. כל אתר קובע את הפורמטים שהוא מקבל, את דרישות המקור ואת כללי ההעלאה. בדקו את הכללים האלה לפני הרכישה. ההמרה אינה מבטיחה ששירות אחר יקבל את הקובץ.
האם הקובץ המומר מכיל מדידות גנטיות נוספות?
לא. הפלט תלוי ברשומות השמישות בקובץ המקור. שינוי הפורמט אינו מודד סמנים נוספים ואינו משחזר נתונים שהושמטו מהייצוא.
איך משתפים את קובץ המקור?
פעלו לפי אפשרות השליחה וההוראות שמוצגות במהלך ההזמנה. שמרו עותק גיבוי של הקובץ המקורי, ובדקו את מידע העיבוד, ההסכמה והשמירה לפני שיתוף נתונים גנטיים.
האם הפלט מתאים לשימוש רפואי?
לא. השירות מיועד למחקר מוצא גנטי, גנאלוגיה, מחקר וחינוך. הקבצים המומרים אינם מיועדים לאבחון, לטיפול או להחלטות רפואיות אחרות.
המרה בכיוון ההפוך
יש לכם קובץ RAW?
השירות ההפוך מכין רשומות RAW תואמות בפורמט VCF, ויש לו דרישות ומגבלות משלו לקלט ולפלט.
המרת VCF ל-RAW
התחילו בבדיקת קובץ המקור.
בדקו את קובץ ה-VCF ואת דרישות הכלי הבא, ואז הזמינו את ההמרה שמתאימה לניתוח שלכם.