قراءاتك.
مرجع مختلف.
حاذِ قراءات التسلسل المدعومة بصيغة FASTQ مع المرجع T2T-CHM13 v2.0. احصل على ملف BAM مفهرس وإحصاءات المحاذاة لاستخدامها في الأبحاث التي تعتمد هذا المرجع.
$66.76طلب واحد · تُؤكَّد تفاصيل الخدمة ومتطلبات الملفات عند الدفع
تقتصر مخرجات الحزمة على المحاذاة. ولا تشمل استدعاء المتغيرات الجينية أو ملف VCF.
يؤثر اختيار المرجع في سياق التحليل.
اختر هذه الخدمة إذا كانت المرحلة التالية تتطلب قراءات محاذاة إلى T2T-CHM13. يمكنك فحص ناتج المحاذاة واستخدامه في الأدوات البحثية المتوافقة.
- ملف BAM مرتب حسب الإحداثياتقراءات تسلسل محاذاة إلى T2T-CHM13 v2.0، جاهزة للاستخدام مع الأدوات المعدّة للعمل بهذا المرجع.
- فهرس ملف BAMيتيح فهرس BAI المقابل الوصول إلى مناطق الجينوم باستخدام البرامج المتوافقة.
- إحصاءات المحاذاةإحصاءات المحاذاة وملخص مقاييس التغطية لمراجعة نتائج المعالجة.
- حدود الحزمةلا تشمل الحزمة استدعاء المتغيرات بصيغة VCF أو توصيفها أو تحويل الأنماط الجينية إلى RAW. تُطلب هذه العمليات بصورة منفصلة.
تحقق من المرجع والبيانات الأصلية.
استخدم التجميع المرجعي نفسه في المحاذاة والتحليل التالي. تعتمد النتائج على القراءات الموجودة وجودتها ومحتوى الملفات.
راجع توافق الملفات- ملفات القراءات
- ملفات FASTQ المدعومة أو FASTQ.GZ المضغوطة، مع مجموعة القراءات الكاملة أحادية الطرف أو مزدوجة الطرف لشخص واحد.
- منصة التسلسل
- تدعم الخدمة معالجة القراءات القصيرة والطويلة. استفسر عن توافق منصتك ونوع القراءات قبل الطلب إذا لزم الأمر.
- المرجع المستخدم
- تستخدم المخرجات المرجع T2T-CHM13 v2.0. يجب أن تتوافق الإحداثيات والتوصيفات والأدوات في المراحل التالية مع هذا المرجع.
من القراءات الأصلية إلى مراجعة المحاذاة
الشراء ونقل الملفات خطوتان منفصلتان. اتبع تعليمات الخدمة الواردة في طلبك.
تحقق من مجموعة القراءات
حدد منصة التسلسل ونمط اقتران القراءات والتحليل البحثي الذي يتطلب محاذاة T2T.
أرسل ملفات الطلب
أكمل عملية الشراء واتبع تعليمات نقل الملفات الواردة في الطلب. تأكد من أن روابط الملفات المشتركة تتيح تنزيلها.
راجع مخرجات المحاذاة
افحص ملف BAM والفهرس والإحصاءات معًا. واستخدم موارد تتوافق مع المرجع في التحليل التالي.
محتويات الحزمة
راجع المخرجات ومتطلبات الملفات معًا. تُعرض الأسعار بالعملة التي اخترتها، وتصدر الفاتورة باليورو.
الخدمة المتاحة / طلب واحد
محاذاة FASTQ إلى T2T
تقتصر مخرجات الحزمة على المحاذاة. ولا تشمل استدعاء المتغيرات الجينية أو ملف VCF.
$66.76
Your purchase at a glance
- You receive
- Sequencing reads aligned to the T2T-CHM13 v2.0 reference, with an index and statistics. Coordinate-sorted BAM, BAI index and alignment-statistics files.
- Covers
- One alignment order for the supported FASTQ read set.
- Access
- One-time alignment processing; use the availability dates shown for delivered downloads.
- You need
- Compatible FASTQ reads and the complete read set required by the order. Check platform, pairing and transfer requirements first.
- Not included
- Variant calling, VCF output and new sequencing are not included. A different reference does not guarantee improved coverage.
After purchaseSubmit the read set using the order's transfer instructions. Follow processing status, then download the BAM, index and statistics from the purchased product when available.
Open your purchases- ملف BAM مرتب حسب الإحداثيات
- فهرس ملف BAM
- إحصاءات المحاذاة
- حدود الحزمة
تقتصر مخرجات الحزمة على المحاذاة. ولا تشمل استدعاء المتغيرات الجينية أو ملف VCF. لا يضمن التحويل قبول الملف لدى خدمة خارجية.
تعرّف على طريقة المعالجة قبل مشاركة الملفات.
ينفّذ فريق الخدمة المعالجة خارج متصفحك. راجع الغرض المحدد وتعليمات الإرسال ومعلومات الاحتفاظ بالبيانات قبل إرسال ملف جيني.
اقرأ سياسة الخصوصية- حدّد الغرض
- اتبع تعليمات الخدمة التي طلبتها. تخزين الملف واستلامه والتحقق منه وإتمام معالجته مراحل منفصلة.
- احتفظ بالملف الأصلي
- احتفظ بنسخة احتياطية من الأصل ونزّل المخرجات التي تحتاج إليها. راجع إشعارات الرفع والنتائج لمعرفة مدة الاحتفاظ المطبقة.
- حدود الاستخدام البحثي
- تدعم المخرجات عمليات البحث المتوافقة. ولا تصلح للتشخيص السريري أو التوصية الطبية أو إثبات الهوية.
ما الذي تشمله الخدمة؟
يسهّل اختيار المدخلات المناسبة وفهم مواصفات المخرجات متابعة التحليل.
اقرأ وثائق المرجع T2Tما المرجع T2T-CHM13؟
إنه تجميع مرجعي للجينوم البشري من مشروع Telomere-to-Telomere. تستخدم هذه الخدمة الإصدار 2.0 للمحاذاة. ولا يمثل التجميع المرجعي إعادة بناء جينومك الشخصي.
هل تتضمن الحزمة ملف VCF؟
لا. تتضمن الحزمة ملف BAM الناتج عن المحاذاة وفهرسه بصيغة BAI وإحصاءات المحاذاة. واستدعاء المتغيرات عملية منفصلة لا تشملها الحزمة.
هل المحاذاة هي نفسها تحويل الإحداثيات؟
لا. تحدد المحاذاة مواضع قراءات التسلسل على المرجع. أما تحويل الإحداثيات فينقل مواضع المتغيرات المعروفة بين التجميعات المدعومة دون إعادة محاذاة القراءات الأصلية.
هل يمكنني تقديم ملف BAM أو CRAM موجود؟
استخدم خدمة تحويل BAM أو CRAM إلى T2T للمحاذاة الموجودة. تختص هذه الصفحة بالقراءات المدعومة بصيغة FASTQ.
هل يتحسن عمق التغطية بالضرورة؟
لا. يؤدي تغيير المرجع إلى تغيير سياق المحاذاة، وتظل المعلومات المتاحة معتمدة على القراءات الأصلية وجودتها وعمقها. ولا تجري الخدمة تسلسلًا جديدًا للحمض النووي.
كيف أرسل الملفات وأستفسر عن مدة المعالجة؟
اتبع تعليمات نقل الملفات المرفقة بالطلب وتواصل مع الدعم للتحقق من رابط أو نوع قراءة عند الحاجة. تعتمد مدة المعالجة على حجم المدخلات وعبء العمل، ولا تحدد هذه الصفحة موعدًا للانتهاء.
هل تصلح النتائج لاتخاذ قرارات سريرية؟
لا. هذه خدمة معالجة للأغراض البحثية. ولم يُتحقق من صلاحيتها كاختبار تشخيصي سريري، ولا ينبغي الاعتماد عليها لاتخاذ قرارات طبية.
هل لديك نوع آخر من الملفات؟
اختر الخدمة الملائمة.
تحويل BAM أو CRAM إلى T2T
أعد محاذاة القراءات من ملف محاذاة موجود.
تعرّف على الخدمةتحويل FASTQ إلى RAW
هل تحتاج إلى حزمة تحويل الأنماط الجينية إلى جانب المحاذاة؟
تعرّف على الخدمةاختر المرجع الذي يتطلبه تحليلك.
راجع مصدر البيانات والمخرجات ومتطلبات الخدمة قبل المتابعة.