القراءات نفسها
بمحاذاة إلى مرجع آخر.
أعد محاذاة بيانات التسلسل المدعومة بصيغة BAM أو CRAM إلى مرجع T2T-CHM13 v2.0. تعرّف على ملف BAM المفهرس وإحصاءات المحاذاة المشمولة في الخدمة.
$66.76طلب واحد. تُؤكَّد الخدمة ومتطلبات الملفات عند الدفع
تعيد الخدمة محاذاة القراءات إلى المرجع. لا تشمل استدعاء المتغيّرات أو إنشاء ملف VCF.
تبدأ إعادة المحاذاة من قراءات التسلسل.
يحتوي ملف المحاذاة على قراءات موضوعة مقابل مرجع. تستخرج الخدمة القراءات المدعومة وتعيد محاذاتها إلى T2T-CHM13 بدل الاكتفاء بتغيير الإحداثيات.
- ملف BAM بعد إعادة المحاذاةمحاذاة مرتّبة حسب الإحداثيات إلى T2T-CHM13 v2.0، للأدوات المتوافقة التي تستخدم هذا المرجع.
- الفهرس والإحصاءاتيُرفق بالناتج فهرس BAM وإحصاءات المحاذاة وملخّص مقاييس التغطية.
- المحاذاة فقطلا تشمل الخدمة استدعاء المتغيّرات أو إنشاء VCF أو التحويل إلى RAW. اختر خدمة مستقلة إذا احتجت إلى هذه الملفات.
تحقّق من المرجع والملف المصدر.
استخدم التجميع المرجعي نفسه في المحاذاة والتحليل التالي. تحدّد القراءات الموجودة وجودتها ومحتويات الملف حدود المعالجة.
استكشف توافق الملفات- محاذاة موجودة
- ملف BAM أو CRAM مدعوم بقراءات محاذاة لشخص واحد. اذكر المرجع الأصلي إن كنت تعرفه.
- تجهيز الملف
- اتّبع متطلبات التحقّق والإرسال في الطلب. توضّح أدوات الرفع معلومات المرجع المقبولة وحدود الملفات.
- محتوى القراءات
- لا تستعيد إعادة المحاذاة القراءات الغائبة عن المصدر. تظل بيانات التسلسل المستهدف أو الإكسوم أو الكروموسومات المحدّدة مقصورة على نطاقها الأصلي.
من قراءات المصدر إلى محاذاة قابلة للمراجعة.
الشراء وإرسال الملفات خطوتان منفصلتان. اتّبع تعليمات الخدمة في طلبك.
راجع المحاذاة الأصلية
حدّد نوع الملف والقراءات والمرجع الأصلي. اسأل الدعم قبل الطلب إذا كانت معلومات الملف ناقصة أو غير مؤكّدة.
أرسل الملف لإعادة المحاذاة
اطلب الخدمة واتّبع تعليمات إرسال الملفات أو رفعها الخاصة بطلبك. تحقّق من الغرض من إعادة المحاذاة.
استخدم المرجع الجديد في التحليلات اللاحقة
راجع ملف BAM وفهرسه وإحصاءاته، ثم استخدم إحداثيات وتعليقات توضيحية متوافقة مع T2T في التحليلات اللاحقة.
محتويات طلبك
راجع الملفات الناتجة ومتطلبات الإدخال معًا. تُعرض الأسعار بالعملة المختارة وتُصدر الفاتورة باليورو.
خدمة معالجة بطلب واحد
إعادة محاذاة ملفات BAM أو CRAM إلى T2T
تعيد الخدمة محاذاة القراءات إلى المرجع. لا تشمل استدعاء المتغيّرات أو إنشاء ملف VCF.
$66.76
Your purchase at a glance
- You receive
- Existing supported reads realigned to T2T-CHM13 v2.0, with an index and statistics. Realigned BAM, its index and alignment-statistics files.
- Covers
- One realignment order for the supported single-person BAM or CRAM source.
- Access
- One-time realignment processing; review order status and delivered-file availability.
- You need
- A compatible aligned BAM or CRAM. Confirm the source reference, alignment state and transfer requirements before ordering.
- Not included
- No VCF, variant annotation, new sequencing or guaranteed coverage improvement. Realignment is distinct from coordinate liftover.
After purchaseSubmit the source alignment using its order instructions. Follow validation and processing status, then obtain the realigned BAM, index and statistics from the purchased product.
Open your purchases- ملف BAM بعد إعادة المحاذاة
- الفهرس والإحصاءات
- المحاذاة فقط
تعيد الخدمة محاذاة القراءات إلى المرجع. لا تشمل استدعاء المتغيّرات أو إنشاء ملف VCF. لا يضمن التحويل قبول الملف لدى خدمة خارجية.
راجع طريقة المعالجة قبل مشاركة الملف.
تُعالَج الملفات خارج متصفّحك. راجع الغرض المبيّن وتعليمات الإرسال ومعلومات الاحتفاظ قبل تقديم ملف جيني.
اقرأ سياسة الخصوصية- الغرض من المعالجة
- اتّبع تعليمات الخدمة التي طلبتها. التخزين والاستلام والتحقّق وإكمال المعالجة مراحل منفصلة.
- احتفظ بالملفات الأصلية
- احتفظ بنسخة أصلية ونزّل الملفات التي تحتاج إليها. راجع إشعارات الرفع والنتائج لمعرفة فترة الاحتفاظ المطبّقة.
- حدود الاستخدام البحثي
- الناتج مخصّص للأبحاث المتوافقة. لا يقدّم تشخيصًا سريريًا أو توصية طبية أو إثباتًا للهوية.
نطاق الخدمة وحدودها
راجع نوع الملف المطلوب ومواصفات الناتج قبل الطلب.
اقرأ وثائق مرجع T2Tهل هذه خدمة نقل الإحداثيات؟
لا. تستخرج الخدمة القراءات المدعومة من محاذاة موجودة وتعيد محاذاتها إلى T2T-CHM13. نقل إحداثيات المتغيّرات عملية منفصلة.
هل سأتلقّى نتائج استدعاء المتغيّرات؟
لا. تتضمّن الملفات المسلّمة ملف BAM بعد إعادة المحاذاة وفهرسه وإحصاءات المحاذاة. ولا تشمل ملف VCF أو التعليقات التوضيحية للمتغيّرات.
هل يمكنني رفع ملف BAM يحتوي على قراءات غير محاذاة؟
اتّبع قواعد التحقّق الموضّحة في الطلب الحالي. تتطلّب الخدمة المدفوعة ملف BAM أو CRAM سبق محاذاته. اسأل الدعم قبل الطلب إذا لم تتأكّد من حالة المحاذاة أو من المرجع المستخدم.
هل تزيد الخدمة تغطية التسلسل؟
لا. تغيّر إعادة المحاذاة مواضع القراءات الموجودة بالنسبة إلى المرجع. لا تنشئ قراءات تسلسل جديدة ولا تضمن تحسّنًا محدّدًا في التغطية.
ماذا لو كانت لديّ ملفات FASTQ؟
راجع خدمة محاذاة FASTQ إلى T2T المستقلة. اختر الخدمة المناسبة لملفات القراءات التي لم تُحاذَ بعد.
متى يمكنني تنزيل النتائج؟
تابع حالة الطلب وتعليمات التسليم الحالية. يؤثّر حجم الملف والتحقّق منه وحجم العمل في المعالجة. راجع معلومات الاحتفاظ الخاصة بالخدمة واحتفظ بنسخ من الملفات التي تحتاج إليها.
هل يمكن استخدام هذه الخدمة للتحليل السريري؟
لا. الخدمة مخصّصة للأبحاث ولا تُستخدم للتشخيص السريري أو لاتخاذ قرارات طبية.
خدمات لملفات
بصيغ أخرى.
محاذاة FASTQ إلى T2T
حاذِ القراءات الخام إذا لم يكن لديك ملف BAM أو CRAM بعد المحاذاة.
استكشف الخدمةتحويل بيانات الجينوم الكامل إلى RAW
اختر استخراج الأنماط الجينية إذا كنت تحتاج إلى ملف RAW.
استكشف الخدمةاختر المرجع الذي يتطلّبه تحليلك.
راجع الملف المصدر والنواتج ومتطلبات الخدمة قبل المتابعة.