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Admixture Studio指南

专注于一组
DNA部分 。

准备片段边界,运行一个选定的计算器,并比较模型依赖的遗传相似性.

阅读指南

Admixture Studio 允许您分析一个目标 RAW 文件的选定片段。这可以帮助您比较一个选定模型如何描述这些片段, 包括其它服务构成文件中列出的边界 。

步骤01

编写片段模板

使用染色体,起始点和终点列在Notepad创建纯文本模板.

片段模板
Chromosome,Start Point,End Point
7,32000000,43000000

纯文本编辑器中的片段模板
一个染色体和两个坐标边界定义了这个段.
步骤02

粘贴和审查边界

复制模板并使用 粘贴 按钮 分析的片段 在继续之前审查添加的段落。

在片段中粘贴按钮到分析面板
粘贴到应用程序中准备的段模板 。
Admixture 工作室中添加的部分
在运行计算器前先审查段列表.
步骤03

运行选中的计算器

在完成您的选择后, 将计算器运行到 全基因组 在目标 RAW 文件上设置模式。在选定方法、设置和引用的同时,审查结果窗口中的输出。

Admixture Studio结果窗口
以计算器和参考语境读取输出 。

不同的计算器或参考面板可以给出对相同片段的不同观点. 比较不是对家族学结论的独立核实.

另一种输入格式

23 and Me 历代组成 CSV

如果您已经有一个兼容的成分导出,请将片段复制到新的纯文本文件中进行分析。 将此页眉添加为它的第一行 :

CSV 页眉
Ancestry,Copy,Chromosome,Start Point,End Point

以下示例显示了预期的列结构。在使用您自己的数据之前,请检查当前导出标签并协调常规 。

CSV 实例
Ancestry,Copy,Chromosome,Start Point,End Point
Northwestern European,2,chr6,120583383,170919470
Northwestern European,1,chr7,127233279,142841959
Northwestern European,1,chr7,145109518,146814694
Northwestern European,1,chr7,148036377,149542524
Northwestern European,2,chr12,3155321,95931927

在目标 RAW 文件上运行选中的计算器,然后在结果页面中查看其输出。 提供者导出格式和应用接口可以更改;这些截图记录了本指南中显示的工作流程 。

运行目标 RAW 文件后示例结果窗口
示例结果界面。此图像不是对您文件的新分析 。