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Guide Admixture Studio

Concentrez-vous sur un ensemble
de segments ADN.

Préparez les limites de segments, exécutez une calculatrice sélectionnée et comparez la similarité génétique selon le modèle.

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Admixture Studio vous permet d’analyser des segments sélectionnés d’un fichier RAW cible. Cela peut vous aider à comparer la façon dont un modèle choisi décrit ces segments, y compris les limites listées dans le fichier de composition d’un autre service.

Étape 01

Préparer un modèle de segments

Créez un modèle en texte brut dans le Bloc-notes avec les colonnes chromosome, point de départ et point de fin.

Modèle de segments
Chromosome,Start Point,End Point
7,32000000,43000000

Modèle de segments dans un éditeur de texte brut
Un chromosome et deux limites de coordonnées définissent le segment.
Étape 02

Coller et vérifier les limites

Copiez le modèle et utilisez le bouton Paste du panneau Segment to Analyze. Vérifiez les segments ajoutés avant de continuer.

Bouton Paste dans le panneau Segment to Analyze
Collez le modèle de segments préparé dans l’application.
Segment ajouté dans Admixture Studio
Vérifiez la liste des segments avant d’exécuter la calculatrice.
Étape 03

Exécuter la calculatrice sélectionnée

Après avoir terminé la sélection, exécutez la calculatrice en mode Genomewide sur le fichier RAW cible. Consultez la sortie dans la fenêtre de résultats avec la méthode, les paramètres et les références sélectionnés.

Fenêtre de résultats d’Admixture Studio
Lisez la sortie avec le contexte de la calculatrice et des références.

Une calculatrice ou un panneau de référence différent peut donner une autre lecture des mêmes segments. Une comparaison ne constitue pas une vérification indépendante d’une conclusion généalogique.

Autre format d’entrée

CSV Ancestry Composition 23andMe

Si vous disposez déjà d’une exportation de composition compatible, copiez les segments à analyser dans un nouveau fichier texte brut. Ajoutez cette en-tête comme première ligne :

En-tête CSV
Ancestry,Copy,Chromosome,Start Point,End Point

L’exemple ci-dessous montre la structure de colonnes attendue. Vérifiez les libellés et les conventions de coordonnées de l’exportation actuelle avant d’utiliser vos propres données.

Exemple CSV
Ancestry,Copy,Chromosome,Start Point,End Point
Northwestern European,2,chr6,120583383,170919470
Northwestern European,1,chr7,127233279,142841959
Northwestern European,1,chr7,145109518,146814694
Northwestern European,1,chr7,148036377,149542524
Northwestern European,2,chr12,3155321,95931927

Exécutez la calculatrice sélectionnée sur le fichier RAW cible, puis consultez sa sortie dans la page de résultats. Les formats d’exportation des fournisseurs et les interfaces peuvent changer ; ces captures documentent le processus présenté dans ce guide.

Exemple de fenêtre de résultats après exécution du fichier RAW cible
Exemple d’interface de résultats. Cette image n’est pas une nouvelle analyse de votre fichier.