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HG19 / HG38 / Conversão de coordenadas

Os mesmos dados de origem.
Um mapa de coordenadas diferente.

Uma ferramenta poderá necessitar de uma montagem de referência diferente do do seu arquivo. O liftover detecta a montagem de origem e converte os dados RAW ou VCF compatíveis com a outra montagem.

$15.63Serviço de pagamento único. Sem assinatura.

A conversão de coordenadas não é uma nova sequência nem uma imputação. As posições que não podem ser mapeadas sem ambiguidades são excluídas.

Escolha de acordo com o seu arquivo de entrada

O formato determina
O que você recebe.

Ambos os processos convertem coordenadas compatíveis. Seus formatos de descarga são diferentes e nenhum adiciona posições não analisadas.

Se partes de um arquivo RAW

Utilize uma exportação RAW compatível em HG19 ou HG38. A montagem convertida é entregue como RAW em ZIP e VCF comprimido com as mesmas posições analisadas.

  • Resultado RAW no ZIPTexto RAW de tipo comercial com estrutura canônica na montagem convertida.
  • Resultado VCF comprimidoUm segundo formato para as mesmas posições mapeadas, não um VCF de genoma completo.

Se partes de um arquivo VCF

Utilize um VCF compatível, sem comprimido ou comprimido, em HG19 ou HG38. O resultado é um VCF comprimido no outro conjunto.

  • Resultado VCF comprimidoRegistos de variantes mapeados e preparados no sistema de coordenadas de destino.
  • A cobertura de origem continua a ser um limiteA conversão não mede variantes ausentes ou substitui dados não disponíveis.
O processo de conversão de coordenadas

Detecta a montagem.
Mapea as posições.

Confirma primeiro a montagem que necessita da seguinte ferramenta. Use a conversão quando a montagem de origem compatível for diferente.

  1. Aporta o arquivo de origem

    RAW ou VCF / Conserva uma cópia

    Siga as instruções de envio do pedido. Os itens suportados incluem exportações RAW de testes comerciais e arquivos VCF sem comprimido ou comprimidos.

  2. Detecta e converte

    HG19 a HG38 / HG38 a HG19

    A montagem de origem é detectada e as posições compatíveis são convertidas para a outra montagem. As posições ambíguas ou sem correspondência são excluídas.

  3. Verifique o arquivo convertido

    Verifique o processo de destino

    Use o formato entregue adequado para a ferramenta seguinte e confirma seus requisitos de montagem e cobertura antes de compartilhar o resultado.

O que muda / O que ainda é um limite

Uma mudança de coordenadas,
com limites de correspondência.

As montagens de referência são diferentes. Uma posição que se mapea sem problemas numa região pode não ter uma correspondência inequívoca em outra montagem.

Muda
O sistema de coordenadas utilizado para descrever posições de variantes compatíveis.
Não adicionado
Novas medições, cobertura de sequenciação ou variantes não genotipadas inferidas.
Podem ser excluídos
As posições que não podem ser mapeadas sem ambiguidades entre as duas montagens. Conserva o arquivo original para comparar.
Continuam a ser independentes
As regras de aceitação de terceiros e as restrições de utilização clínica. A coincidência da montagem não garante, por si só, a adequação.
Contrata o serviço

Um arquivo compatível.
A outra montagem de referência.

Escolha o serviço depois de verificar se o destino necessita de HG19 ou HG38. O tipo de arquivo determina os formatos de resultado disponíveis.

Servicio de conversión de pago único

Conversão de coordenadas de DNA (HG19 / HG38)

Converte as coordenadas de um arquivo RAW ou VCF compatível com o HG19/GRCh37 para o HG38/GRCh38 ou para o endereço inverso.

$15.63

Sua compra de uma olhada

Recebes
Posições de origem mapeadas sem ambiguidade no outro montagem de referência compatível. Entradas RAW: RAW em ZIP e VCF comprimido. VCF: VCF comprimido.
Inclui
Um arquivo RAW ou VCF compatível, convertido entre HG19/GRCh37 e HG38/GRCh38.
Acesso
Serviço de conversão de coordenadas de pagamento único; a disponibilidade de descarga é indicada no produto entregue.
Precisas
Um arquivo de origem compatível em HG19 ou HG38 e um requisito claro de montagem de destino.
Não inclui
As posições ambíguas ou sem correspondência são excluídas. Não inclui alinhamento de leituras a T2T, imputação ou nova detecção de variantes.

Depois de comprarSiga as instruções de envio do pedido. Baixe o arquivo convertido do produto adquirido e conserva a identificação da sua montagem de referência de saída.

Abrir as suas compras (em inglês)
  • Detecção da montagem de origem
  • RAW e VCF comprimido para entradas RAW, ou VCF comprimido para entradas VCF
  • Posições mapeadas sem ambiguidade no outro montagem de referência
Comprar Conversão de coordenadas de DNA (HG19 / HG38) (em inglês)

Siga as instruções de envio do pedido. Consulta as informações de tratamento, consentimento e conservação desse processo e Política de privacidade. Apenas para investigação e educação; estes arquivos convertidos não devem ser utilizados para diagnóstico clínico ou decisões médicas.

Antes de contratar

Mantenha a montagem
No seu contexto.

As coordenadas de referência indicam onde se situa um cadastro; não implicam que o DNA adicional tenha sido medido.

O que é uma montagem do genoma de referência?

Uma montagem do genoma de referência é o sistema de coordenadas utilizado para descrever posições em cada cromossomo. HG19/GRCh37 e HG38/GRCh38 são montagens distintas; a ferramenta receptora pode exigir um concreto.

Tenho que identificar a montagem de origem antes de contratar?

O serviço detecta se um item compatível está em HG19 ou HG38 e converte-o para o outro montagem. Você deve verificar o que montagem precisa do destino.

Quais tipos de arquivos são compatíveis?

As entradas suportadas incluem exportações RAW de DNA e arquivos VCF compatíveis, sem comprimir ou comprimidos, em HG19/GRCh37 ou HG38/GRCh38. Contacte se o formato ou a montagem de origem não está claro.

O que recebo se eu aporto um arquivo RAW?

Os itens RAW recebem um arquivo de tipo comercial RAW no ZIP e um VCF comprimido com as mesmas posições analisadas e mapeadas na montagem convertida. O VCF não é um arquivo de genoma completo.

O que recebo se eu aporto um arquivo VCF?

Os itens VCF recebem um VCF comprimido no outro conjunto compatível.

Podem perder-se posições durante o liftover?

Sim. As posições sem correspondência inequívoca entre HG19 e HG38 são excluídas. Conserva o arquivo original e analisa o resultado convertido antes de utilizar em outro processo.

Realiza alinhamento a T2T ou imputação?

Não. Este serviço converte coordenadas existentes compatíveis entre HG19 e HG38. Não realinea leituras de sequenciamento, nem cria uma montagem nem infere variantes não genotipadas.

O resultado é adequado para decisões médicas?

Não. O liftover destina-se a processos de investigação e educação. Os arquivos convertidos não devem ser utilizados para diagnóstico clínico ou decisões médicas.

Você precisa mudar o formato em vez da montagem?

Se as suas coordenadas já estiverem na montagem adequada, você pode precisar de um serviço de conversão de formato.

Conversión de coordenadas de DNA

Use o sistema de coordenadas que você precisa da sua ferramenta.

Verifique a montagem necessária, conserva o arquivo original e contrata o liftover HG19/HG38 adequado.

Analisamos DNA antigo e atual desde 2018

O DNA Genics desenvolve relatórios de ascendência e análise de DNA desde 2018, com painéis de referência, calculadoras e comparações com genomas antigos desenvolvidos e revisados por nossa equipe. As funções opcionais que utilizam IA são identificadas como tais.

Sobre DNA Genics