Dos dados de sequenciamento
a um arquivo RAW utilizável.
Converte alinhamentos BAM ou CRAM compatíveis em arquivos RAW de genótipos, com extratos cromossômicos e estimativas de haplogrupos disponíveis. Começa pelos requisitos do arquivo.
$35.17Um pedido · O serviço e os requisitos definitivos do arquivo são confirmados ao contratar
A cobertura e o conteúdo cromossômico determinam o que pode ser entregue. Este é o serviço completo de conversão existente.
Um alinhamento não é um arquivo RAW de um teste comercial.
Este serviço extraia genótipos de alinhamentos de sequenciação compatíveis. É diferente de reorganizar o formato de um VCF ou de alinhar leituras FASTQ sem processar.
- Arquivos RAW de genótiposO resultado RAW completo suportado e uma seleção menor de cerca de 2,5 milhões de favoritos. As chamadas disponíveis dependem da cobertura e da qualidade; um conjunto de favoritos com nome não garante que estejam presentes todas as posições.
- Estimações de haplogruposEstimativas de DNA-Y e DNA mitocondrial quando estão presentes as leituras cromossômicas necessárias. Uma estimativa indica um ramo de linhagem; não demonstra um antepassado concreto nem uma relação familiar.
- Extractos cromossômicosResultados mitocondriais BAM, VCF e FASTA disponíveis, com extratos do cromossomo Y e combinados quando a entrada o permitir. Consulta os requisitos do serviço receptor antes de utilizar uma exportação.
Começa pelo arquivo de origem adequado.
Escolha o serviço de acordo com o arquivo que você tem. Uma exportação de genótipos, um arquivo de variantes, um alinhamento e um conjunto de leituras contêm informações diferentes.
Consultar a compatibilidade de arquivos- Arquivo de Origem
- Um BAM ou CRAM completo de uma única pessoa que contenha leituras alinhadas. A subida para a conversão RAW padrão requer GRCh37/hg19 ou GRCh38/hg38.
- Cobertura cromossómica
- A conversão de formato não recupera leituras mitocondriais ou do cromossoma Y ausentes. Alguns CRAM de fornecedores omitem estas regiões.
- Cobertura e tipos de variantes
- Os dados de exoma, de regiões específicas ou apenas do cromossoma Y não fornecem cobertura de todo o genoma. A conversão RAW tem limitações para o INDEL e outras representações diferentes de SNP.
Prepare a origem. Verifique o resultado.
A compra e a transferência de arquivos são passos diferentes. Siga as instruções do serviço do seu pedido.
Verifique o alinhamento
Confirma o tipo de arquivo, a montagem de referência e a pessoa a que corresponde. Contacte o suporte se a origem ou a cobertura cromossómica não estiver clara.
Contrata o serviço adequado
Contrate a conversão WGS completa quando disponível. Utilize as instruções de envio do pedido e confirma a finalidade do tratamento indicada.
Rever e guarda o resultado
Verifique o estado do pedido, verifique os arquivos gerados e baixe os resultados disponíveis. Verifique a informação de conservação da subida e do resultado.
O pacote que você contrata.
Verifique em conjunto as entregas e os requisitos de entrada. Os preços são apresentados na sua moeda seleccionada; são facturados em EUR.
Servicio existente / Un pedido
Converter WGS (CRAM/BAM) para arquivos RAW
A cobertura e o conteúdo cromossômico determinam o que pode ser entregue. Este é o serviço completo de conversão existente.
$35.17
Sua compra de uma olhada
- Recebes
- Resultado RAW de genótipos, extratos cromossômicos disponíveis e estimativas de haplogrupos admitidas. Ficheiros RAW e cromossómicos descarregados; os resultados disponíveis dependem das leituras de entrada.
- Inclui
- O serviço completo de conversão de um alinhamento BAM ou CRAM compatível, completo e de uma única pessoa.
- Acesso
- Um pedido de conversão. O estado de processamento e descarga é mostrado no processo existente de encomendas e produtos adquiridos.
- Precisas
- Um BAM/CRAM alinhado compatível em GRCh37/hg19 ou GRCh38/hg38, com cobertura adequada e leituras cromossômicas necessárias.
- Não inclui
- Os resultados do DNA-Y e do DNA mitocondrial dependem de leituras utilizáveis. Gravar um arquivo na biblioteca WGS não contrata nem inicia a conversão; não é garantida a aceitação por terceiros.
Depois de comprarSiga as instruções de arquivo do serviço adquirido. Completa os passos de validação e envio, consulta o estado do pedido e descarrega os resultados disponíveis do produto adquirido.
Abrir as suas compras (em inglês)- Ficheiros RAW de genótipos
- Estimações de haplogrupos
- Extractos cromossômicos
A cobertura e o conteúdo cromossômico determinam o que pode ser entregue. Este é o serviço completo de conversão existente. A conversão não garante a aceitação por um serviço de terceiros.
Conheça o tratamento antes de compartilhar.
Este é um serviço gerido. Não é um cálculo local do navegador. Verifique a finalidade indicada, as instruções de envio e as informações de conservação antes de fornecer um arquivo genético.
Ler a Política de Privacidade- Confirmar a finalidade
- Use as instruções do serviço contratado. O armazenamento, a recepção, a validação e o processamento completado são fases distintas.
- Conserva o seu arquivo de origem
- Conserva uma cópia do original e descarrega o resultado necessário. Consulta os avisos de subida e resultados para conhecer o período de conservação aplicável.
- Limites de investigação
- O resultado permite processos de pesquisa compatíveis. Não é um diagnóstico clínico, uma recomendação médica ou um teste de identidade.
Tenha claros os limites.
Uma entrada adequada e especificações claras do resultado facilitam o próximo passo.
O que inclui este pacote?
O pacote completo de conversão WGS fornece os resultados RAW e os arquivos cromossômicos disponíveis descritos nesta página. Verifique a cobertura de leituras necessária e o serviço do pedido antes de comprar.
Posso fornecer um BAM ou CRAM de qualquer fornecedor?
O arquivo deve ultrapassar as verificações do pedido seleccionado. A conversão RAW padrão requer um alinhamento completo de uma única pessoa em GRCh37/hg19 ou GRCh38/hg38. O nome do fornecedor não garante a compatibilidade; consulta com o suporte se o formato ou a referência não estiver claro.
Os resultados do DNA-Y e do DNA mitocondrial são assegurados?
Não. As leituras correspondentes devem estar presentes e ser utilizáveis. Algumas exportações de CRAM, incluindo os arquivos de MyHeritage descritos no guia existente, omitem dados mitocondriais ou do cromossoma Y. Os genótipos RAW mitocondriales de CRAM de Nebula têm limitações documentadas. Verifique os resultados cromossômicos e as estimativas no seu contexto.
O resultado funcionará em outro site de DNA?
Cada serviço receptor estabelece os seus formatos admitidos, cobertura mínima de marcadores e outras normas. A conversão não garante a aceitação, uma coincidência concreta ou um resultado de ascendência.
Onde enviar o arquivo de um pedido existente?
Use as instruções de arquivo do pedido. A área de pedidos WGS oferece controles de subida para os pedidos elegíveis quando disponíveis. Gravar um arquivo na biblioteca WGS independente não contrata nem inicia uma conversão.
Como é que os arquivos genéticos são tratados?
Verifique a confirmação de tratamento, o aviso de conservação e a Política de Privacidade da subida seleccionada antes de enviar um arquivo. Os requisitos e os prazos de eliminação podem variar por serviço; conserva o original e descarrega os resultados que deseja gravar.
Você tem outra entrada?
Um serviço diferente.
VCF para RAW
Você já tem variantes detectadas? Consulta o serviço de conversão de formato.
Consultar o ServiçoFASTQ para RAW
Parte de leituras de sequenciação em vez de um alinhamento existente.
Consultar o ServiçoPrepare seus dados para o próximo passo.
Verifique a origem, os resultados entregues e os requisitos do serviço antes de continuar.