Gardez les lectures.
Revisitez la référence.
Réalignez des données de séquençage BAM ou CRAM prises en charge sur T2T-CHM13 v2.0. Consultez le BAM indexé et les statistiques d'alignement en sachant précisément ce que comprend le forfait.
$62.52Une commande · Le service définitif et les exigences de fichier sont confirmés au paiement
Un service de réalignement, pas un simple changement d'étiquettes de coordonnées. L'appel de variants et un VCF ne sont pas inclus.
Le réalignement revient aux lectures.
Un alignement existant contient des lectures placées sur une référence. Ce flux extrait les lectures prises en charge et les réaligne sur T2T-CHM13, plutôt que de simples étiquettes de coordonnées.
- BAM réalignéUn alignement trié par coordonnées sur T2T-CHM13 v2.0, pour les outils compatibles qui utilisent cette référence.
- Index et statistiquesL'index BAM, les statistiques d'alignement et les métriques de synthèse de couverture accompagnent la sortie.
- Alignement uniquementCe forfait n'inclut pas l'appel de variants, un VCF ni une conversion RAW. Choisissez un service distinct lorsque ce sont là les sorties dont vous avez besoin.
La référence compte. La source aussi.
Gardez des assemblages de référence cohérents entre l'alignement et votre analyse suivante. Les lectures existantes, leur qualité et le contenu du fichier demeurent les limites du flux.
Explorer la compatibilité des fichiers- Alignement existant
- Un BAM ou CRAM pris en charge avec des lectures de séquençage alignées d'une seule personne. Identifiez sa référence d'origine lorsque vous la connaissez.
- Préparation du fichier
- Suivez les exigences de validation et d'envoi de la commande sélectionnée. Les contrôles de téléversement en vigueur expliquent les informations de référence acceptées et les limites de fichier.
- Contenu des lectures
- Le réalignement ne peut pas récupérer les lectures omises à la source. Les données ciblées, exome ou limitées à un chromosome restent contraintes par ce contenu.
Des lectures sources à un alignement vérifié.
L'achat et le transfert de fichier sont des étapes distinctes. Suivez les instructions du service indiquées sur votre commande.
Examiner l'alignement source
Identifiez le type de fichier, les données de lecture et la référence d'origine. Contactez le support pour toute entrée incertaine ou incomplète avant de commander.
Envoyer pour réalignement
Utilisez l'achat du service existant et les instructions de transfert ou de téléversement propres à la commande. Confirmez l'objectif du traitement de réalignement.
Utiliser la nouvelle référence de façon cohérente
Consultez le BAM, l'index et les statistiques, puis employez des coordonnées et annotations compatibles T2T dans le travail en aval.
Le forfait que vous commandez.
Vérifiez ensemble les livrables et les exigences d'entrée. Les prix affichés utilisent votre devise d'affichage\u00A0; la facturation est en EUR.
Service existant / Une commande
Alignement BAM/CRAM vers T2T
Un service de réalignement, pas un simple changement d'étiquettes de coordonnées. L'appel de variants et un VCF ne sont pas inclus.
$62.52
Votre achat en un coup d’œil
- Vous recevez
- Lectures existantes compatibles réalignées sur T2T-CHM13 v2.0, avec index et statistiques. BAM réaligné, son index et fichiers de statistiques d'alignement.
- Couvre
- Une commande de réalignement pour la source BAM ou CRAM compatible d'une seule personne.
- Accès
- Traitement de réalignement en une seule fois ; consultez l'état de la commande et la disponibilité des fichiers livrés.
- Il vous faut
- Un BAM ou CRAM aligné compatible. Confirmez la référence source, l'état d'alignement et les exigences de transfert avant de commander.
- Non inclus
- Pas de VCF, d'annotation de variants, de nouveau séquençage ni de garantie d'amélioration de la couverture. Le réalignement est distinct du liftover des coordonnées.
Après l’achatEnvoyez l'alignement source selon les instructions de la commande. Suivez l'état de validation et de traitement, puis récupérez le BAM réaligné, l'index et les statistiques depuis le produit acheté.
Ouvrir vos achats (en anglais)- BAM réaligné
- Index et statistiques
- Alignement uniquement
Un service de réalignement, pas un simple changement d'étiquettes de coordonnées. L'appel de variants et un VCF ne sont pas inclus. La conversion ne garantit pas l'acceptation par un service tiers.
Comprenez le traitement avant de partager.
Il s'agit d'un service géré, et non d'un calcul local dans le navigateur. Vérifiez l'objectif indiqué, les instructions d'envoi et les informations de conservation avant de fournir un fichier génétique.
Lire la Privacy Policy (en anglais)- Choisir l'objectif
- Utilisez les instructions du service que vous avez commandé. Le stockage, la réception, la validation et le traitement terminé sont des étapes distinctes.
- Conserver votre source
- Gardez une sauvegarde de l'original et téléchargez la sortie dont vous avez besoin. Consultez les avis de téléversement et de résultat pour la durée de conservation applicable.
- Limites de recherche
- La sortie prend en charge des flux de recherche compatibles. Elle n'est pas un diagnostic clinique, une recommandation médicale ni une preuve d'identité.
Gardez les limites claires.
La bonne entrée et des spécifications de sortie claires facilitent l'étape suivante.
Lire la documentation de référence T2TS'agit-il d'un service de liftover ?
Non. Ce service extrait les lectures prises en charge d'un alignement existant et les réaligne sur T2T-CHM13. Le liftover convertit les coordonnées de variants et constitue une opération distincte.
Recevrez-vous des variants appelés ?
Non. Le forfait livré contient le BAM réaligné, l'index et les statistiques d'alignement. Un VCF et l'annotation de variants ne sont pas inclus.
Puis-je téléverser ici des lectures BAM non alignées ?
Suivez les règles de validation de la commande en cours. Le téléversement BAM/CRAM payant attend une entrée alignée ; contactez le support avant de commander si l'état d'alignement ou la référence source est incertain.
Cela ajoute-t-il de la couverture de séquençage ?
Non. Le réalignement modifie la façon dont les lectures existantes sont placées sur une référence. Il ne génère pas de nouvelles lectures de séquençage et ne garantit pas une amélioration particulière de la couverture.
Et si j'ai des fichiers FASTQ ?
Consultez le service distinct FASTQ vers T2T. Choisir le bon flux d'entrée évite de commander un réalignement pour des fichiers qui restent des lectures non alignées.
Quand puis-je télécharger les résultats ?
Suivez l'état de la commande et les instructions de livraison en vigueur. La taille d'entrée, la validation et la charge de travail influencent le traitement ; consultez les informations de conservation propres au service et conservez des copies des sorties dont vous avez besoin.
Puis-je utiliser ceci pour une analyse clinique ?
Non. Le service s'adresse aux flux de recherche, pas au diagnostic clinique ni aux décisions médicales.
Une entrée différente\u00A0?
Un service différent.
FASTQ vers T2T
Alignez des lectures brutes lorsque vous n'avez pas de BAM ou CRAM existant.
Découvrir le serviceWGS vers RAW
Choisissez l'extraction de génotypes lorsque le fichier RAW est la sortie requise.
Découvrir le serviceChoisissez la référence dont votre flux a besoin.
Vérifiez la source, les livrables et les exigences du service avant de poursuivre.