Conserva as leituras.
Verifique a referência.
Realinea dados de sequenciação BAM ou CRAM compatíveis com T2T-CHM13 v2.0. Revise o BAM indexado e as estatísticas de alinhamento tendo claro o que inclui o pacote.
$62.52Um pedido · O serviço e os requisitos definitivos do arquivo são confirmados ao contratar
Um serviço de realinhamento, não uma simples mudança de etiquetas de coordenadas. Não inclui detecção de variantes nem um VCF.
O realinhamento volta às leituras.
Um alinhamento existente contém leituras situadas sobre uma referência. Este processo extrai leituras compatíveis e as realinea com T2T-CHM13; não se limita a alterar etiquetas de coordenadas.
- BAM realineadoUm alinhamento ordenado por coordenadas com T2T-CHM13 v2.0, para ferramentas compatíveis que utilizem essa referência.
- Índice e estatísticasO resultado é acompanhado do índice BAM, estatísticas de alinhamento e métricas de resumo de cobertura.
- Apenas alinhamentoEste pacote não inclui detecção de variantes, VCF ou conversão RAW. Escolha um serviço independente se precisar desses resultados.
A referência importa. A origem também.
Use as montagems de referência coerentes entre o alinhamento e a próxima análise. As leituras existentes, a sua qualidade e o conteúdo do arquivo continuam a limitar o processo.
Consultar a compatibilidade de arquivos- Alinhamento existente
- Um BAM ou CRAM compatível com leituras de sequenciação alinhadas de uma pessoa. Identifica sua referência original quando você a conhece.
- Preparação do arquivo
- Siga os requisitos de validação e envio do pedido seleccionado. Os controlos de subida em vigor explicam as informações de referência suportadas e os limites do arquivo.
- Conteúdo das leituras
- O realineamento não recupera leituras omitidas da origem. Os dados de regiões específicas, exoma ou cromossomos concretos permanecem limitados por esse conteúdo.
Das leituras de origem a um alinhamento revisado.
A compra e a transferência de arquivos são passos diferentes. Siga as instruções do serviço do seu pedido.
Rever o alinhamento de origem
Identifica o tipo de arquivo, os dados de leitura e a referência original. Consulta com suporte os itens incertas ou incompletos antes de contratar.
Envia para realinhamento
Use a compra do serviço existente e as instruções de transferência ou subida do pedido. Confirma a finalidade do tratamento de realinhamento.
Usar a nova referência de forma coerente
Verifique o BAM, o índice e as estatísticas e utiliza coordenadas e anotações compatíveis com T2T no trabalho posterior.
O pacote que você contrata.
Verifique em conjunto as entregas e os requisitos de entrada. Os preços são apresentados na sua moeda seleccionada; são facturados em EUR.
Servicio existente / Un pedido
Alinhamento de BAM/CRAM a T2T
Un servicio de realineamiento, no un simple cambio de etiquetas de coordenadas. No incluye detección de variantes ni un VCF.
$62.52
Sua compra de uma olhada
- Recebes
- Leituras existentes compatíveis realinhadas com T2T-CHM13 v2.0, com índice e estatísticas. BAM realineado, seu índice e arquivos de estatísticas de alinhamento.
- Inclui
- Um pedido de realinhamento para o BAM ou CRAM de origem compatível de uma pessoa.
- Acesso
- Processamento de realinhamento de pagamento único; consulta o estado do pedido e disponibilidade dos arquivos entregues.
- Precisas
- Um BAM ou CRAM alinhado compatível. Confirma a referência de origem, o estado de alinhamento e os requisitos de transferência antes de contratar.
- Não inclui
- Sem VCF, anotação de variantes, nova sequência ou garantia de melhoria de cobertura. O realinhamento é diferente da conversão de coordenadas.
Depois de comprarEnvia o alinhamento de origem segundo as instruções do pedido. Consulta o estado de validação e processamento e obtén o BAM realineado, o índice e as estatísticas do produto adquirido.
Abrir as suas compras (em inglês)- BAM realineado
- Índice e estatísticas
- Apenas alinhamento
Um serviço de realinhamento, não uma simples mudança de etiquetas de coordenadas. Não inclui detecção de variantes ou VCF. Não é garantida a aceitação por um serviço de terceiros.
Conheça o tratamento antes de compartilhar.
Este é um serviço gerido. Não é um cálculo local do navegador. Verifique a finalidade indicada, as instruções de envio e as informações de conservação antes de fornecer um arquivo genético.
Ler a Política de Privacidade- Confirmar a finalidade
- Use as instruções do serviço contratado. O armazenamento, a recepção, a validação e o processamento completado são fases distintas.
- Conserva o seu arquivo de origem
- Conserva uma cópia do original e descarrega o resultado necessário. Consulta os avisos de subida e resultados para conhecer o período de conservação aplicável.
- Limites de investigação
- O resultado permite processos de pesquisa compatíveis. Não é um diagnóstico clínico, uma recomendação médica ou um teste de identidade.
Tenha claros os limites.
Uma entrada adequada e especificações claras do resultado facilitam o próximo passo.
Ler a documentação de referência T2T (em inglês)É um serviço de liftover?
Não. Este serviço extrai leituras compatíveis de um alinhamento existente e as realinea com T2T-CHM13. O liftover converte coordenadas de variantes e é uma operação diferente.
Recibo variantes detectadas?
Não. O pacote entregue contém o BAM realineado, o índice e as estatísticas de alinhamento. Não inclui VCF nem anotação de variantes.
Posso subir aqui leituras BAM sem alinhar?
Segue as regras de validação em vigor do pedido. A subida BAM/CRAM de pagamento requer uma entrada alinhada; consulta com suporte antes de contratar se não for claro o estado de alinhamento ou a referência de origem.
Añade cobertura de sequenciamento?
Não. O realineamento muda como as leituras existentes se situam sobre uma referência. Não gera novas leituras de sequenciamento nem garante uma melhoria concreta de cobertura.
E se eu tiver arquivos FASTQ?
Consulta o serviço independente FASTQ a T2T. Escolha o processo adequado para a entrada evita contratar realinhamento para arquivos que ainda são leituras sem alinhar.
Quando posso baixar os resultados?
Consulta o estado do pedido e as instruções de entrega vigentes. O tamanho de entrada, a validação e a carga de trabalho afetam o processamento; revisa a conservação específica do serviço e guarda cópias dos resultados que você precisa.
Posso usá-lo como análise clínica?
Não. O serviço está destinado a processos de pesquisa, não a diagnóstico clínico nem a decisões médicas.
Você tem outra entrada?
Um serviço diferente.
FASTQ a T2T
Alinha leituras sem processar quando não tiver um BAM ou CRAM existente.
Consultar o ServiçoWGS para RAW
Escolha a extracção de genótipos quando o resultado necessário for um arquivo RAW.
Consultar o ServiçoEscolha a referência que você precisa do seu processo.
Verifique a origem, os resultados entregues e os requisitos do serviço antes de continuar.