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G25 Studio / Manual para iniciantes

A sua primeira
comparación G25.

Compreende as coordenadas, escolha um painel de referência e segue uma primeira execução simples. Depois aprende a ler o modelo tendo presentes as suas limitações.

Este guia é dirigido aos que começam com as coordenadas G25 y G25 Studio. Explica as ideias com linguagem simples, propõe uma primeira análise e liga com documentação mais detalhada para quando quiser aprofundar.

Para conhecer o conjunto de funções, consulta G25 Studio.

A quem vai dirigida este guia

Este manual será especialmente útil se:

  • Você quer entender o que são as coordenadas G25 Antes de interpretar percentagens.
  • Pensas utilizar G25 Studio para comparar o seu DNA com populações de referência e executar modelos de ascendência.
  • Você prefere começar com um passeio prático curto e deixar os detalhes opcionais para depois.

Não Você precisa de formação em genética. Se você precisa de suas próprias coordenadas ou uma forma de as obter (consulta Antes de começar).

O que são as coordenadas G25

Las coordenadas G25 (Global 25) são uma descrição numérica compacta do seu DNA autossômico 25 dimensões. Cada dimensión recoge parte de la relación entre tu genoma y un amplio marco de referencia construido mediante Análise de componentes principais (PCA).

Pense nas coordenadas como uma posição num espaço genético, no como una historia por sí mismas. Son la entrada você fornece ferramentas como G25 Studio. Os percentagem étnica e as barras de mistura São saídas de modelar suas coordenadas frente a um conjunto escolhido de populações de referência. São uma camada de interpretação, não as próprias coordenadas RAW.

Coordenadas escaladas e sem escalar

  • As Coordenadas escaladas ponderam as dimensões segundo a variação genética que explicam. São a opção habitual para modelos de ascendência em processos G25.
  • As Coordenadas sem escalar Eles mantêm a escala original do tipo PCA. Podem ser úteis para determinadas comparações de pesquisa.

Use as coordenadas que Corresponder com o que espera calculadora, escaladas ou sem escalar. Misturar os tipos por erro normalmente produzir resultados confusos ou enganosos.

O que não são as coordenadas

  • Não são um diagnóstico médico.
  • Não São um registro genealógico ou um teste de um antepassado concreto.
  • Não São um certificado de etnia ou de nacionalidade.

Antes de começar

O que você precisa

  1. Uma DnaGenics e um navegador Web moderno com JavaScript habilitado.
  2. Coordenadas G25 da amostra que você quer analisar (consulta abaixo).
  3. Uns minutos para a primeira execução. As visualizações complexas e os conjuntos populacionais grandes podem demorar mais.

Como obter coordenadas G25

As vias habituais incluem:

  • Serviços de geração de coordenadas: Se precisar de as obter de um arquivo RAW compatível, consulte as Opções de Coordenadas G25 e a loja para conhecer disponibilidade e requisitos atuais.
  • Suas amostras processadas: Se você já tiver coordenadas de um serviço completo, você pode aparecer junto à amostra ou na área de downloads.
  • Coordenadas de referência: para aprender, você pode usar coordenadas da biblioteca do G25 Studio, que não representam o seu genoma pessoal.

Se você só tem DNA RAW e ainda não tem coordenadas, completa sua geração antes de esperar resultados interpretáveis em G25 Studio.

Formato de uma linha de coordenadas

G25 Studio espera uma linha com um nome seguido de 25 números separados por vírgulas:

Exemplo de linha de coordenadas
MySample_scaled,0.0234,-0.0156,0.0089,-0.0312,0.0178,0.0123,-0.0098,0.0211,-0.0145,0.0067,-0.0189,0.0256,-0.0112,0.0198,-0.0076,0.0143,-0.0221,0.0095,-0.0167,0.0134,-0.0109,0.0182,-0.0126,0.0078,-0.0094

É um exemplo fictício de formato, não um resultado medido nem uma população de referência. Cópia para examinar o formato e usa depois seus dados permitidos ou uma referência da biblioteca para comparar. O importante é: uma etiqueta e depois 25 valores, separados por comas.

Três formas de carregar coordenadas em G25 Studio

No tela principal do G25 Studio, você pode:

  1. Colar uma linha de coordenadas no campo de entrada.
  2. Usar From Library (Desde a biblioteca) para escolher as coordenadas de referência selecionadas.
  3. Usar From Samples (Desde as amostras) para carregar coordenadas ligadas às suas amostras subidas, quando disponíveis.

As marcas dos botões da aplicação são mantidas para que você possa seguir os passos enquanto você trabalha.

Como funciona o G25 Studio

G25 Studio é um ambiente de análise de ascendência: proporcionas coordenadas, escolhes uma calculadora, ajustas la Configuração, ejecutas el análisis y lees los Resultados.

De forma geral:

Fluxo de Studio
Coordenadas -> Calculadora -> Configuración -> Análisis -> Resultados

O que é uma calculadora?

Uma calculadora é um conjunto identificado de populações de referência, antiguas, modernas o ambas, junto con metadatos como el tipo de coordenadas, la época y el autor. Tus coordenadas se comparan con esas referencias para obtener distâncias, %s de tipo mistura e gráficos opcionais.

Calculadoras diferentes produzem resultados diferentes porque cada uma considera apenas as populações que inclui. Uma calculadora focada em uma região costuma oferecer mais detalhes. Uma calculadora global oferece uma visão mais ampla, mas às vezes menos detalhada. A escolha depende da pergunta que você quer responder.

Por que importa escolher a calculadora

O seu genoma é moldado como uma mistura das populações conhecidas pela calculadora. Se não contém boas referências para uma parte de sua ascendência, essa parte pode Dar cartas entre outras populações ou mostrar um ajuste pior. Es una limitación del panel de referencia, no una valoración de tu DNA.

Sua primeira análise como iniciante

Segue este percurso pela primeira vez. Você pode adicionar complexidade depois.

  1. Carregar as Coordenadas penteando-as ou com From Library o From Samples.
  2. Abre Browse Calculators (Explorar Calculadores) e escolha uma adequada para a sua pergunta. Verifique as suas referências, tipo de coordenadas e alcance; um painel amplo pode ser um ponto de partida útil.
  3. Abre a área de Configuração e selecione:
    • Algorithm (Algoritmo): Montecarlo V1, opção padrão e acessível.
    • Distance (Distância): Euclidean, uma opção de uso geral.
    • Maximum populations (Máximo de populações): umas 5 Para facilitar a leitura.
    • Group populations (Agrupar populações): ativado se você quiser um resumo mais regional.
    • Ancestors Predictions (Oracle): Desactivado na primeira execução. Active isto depois para explorar cenários hipotéticos de várias populações.
    • Analysis tools ( Ferramenta de análise): activa apenas PCA para uma referência visual rápida.
  4. Carregue Calculate Results (Calcular resultados) e espera que termine.

Este percurso segue as recomendações da Configurar o Guide (Guia de Configuração) da aplicação para uma primeira análise.

Como ler os resultados

Qual a composição de mistura (estilo Monte Carlo)

A ferramenta tenta reconstruir suas coordenadas como uma mistura de populações de referência com Taxas flexíveis. Son pesos ajustados dentro del modelo elegido, no probabilidades de descendencia. Não significam que você tenha um antepassado recente de cada grupo rotulagem.

Pontuações do ajuste

La pontuação de ajuste mede até que ponto as referências dessa calculadora reconstruem suas coordenadas. Um resíduo menor indica melhor ajuste dentro do mesmo método, painel e configuração. No demuestra una historia familiar más exacta.

O ajuste possível depende da calculadora e da métrica. Um resíduo maior pode indicar que o painel representa mal o item. Verifique o tipo de coordenadas e a cobertura de referência e compara outros modelos. Os escores de métodos ou configurações diferentes não são automaticamente comparáveis.

Poblações mais próximas (muitas vezes relacionadas com o Oracle)

Las populações mais próximas Destacam-se referências cujas coordenadas estão mais perto das suas no espaço G25. É uma ideia de proximidade. Não equivale às percentagens de mistura, que otimizam uma combinação. Ambas son útiles y responden a preguntas ligeramente distintas.

Cronologia de ascendência (quando se mostra)

Se aparecer uma cronologia, léela junto com seu método e seus pressupostos. As etiquetas históricas ou estimativas do modelo não datam um vínculo familiar concreto nem estabelecem quando entrou um componente na genealogia de uma pessoa. Interprétala como contexto de pesquisa, não como uma árvore genealógica fechada.

Acesso gratuito e PRO

Alguns algoritmos, métricas de distância, opções de personalização de populações, visualizações adicionais e quantidades ampliadas de resultados Oracle são funções PRO. Si un control está bloqueado ou requer uma ampliação, você pode aprender o processo com Montecarlo V1, distancia Euclidean y PCA.

Consulta apresentação do Studio e os controles da sua conta para conhecer as funções actuais. Ler este manual não concede funções de pagamento nem gera coordenadas.

Monte Carlo e Oracle

No G25 Studio, a saída do tipo Oracle é configurada em Ancestors Predictions.

  • Monte Carlo (modelos de mistura): procura uma combinação flexível de populações e pesos que ajuste suas coordenadas. Pergunta o que mistura das referências disponíveis reconstrue a entrada com a configuração escolhida.
  • Oracle (Ancestors Predictions): explora cenários de proporções fixas, como repartos iguales entre dos, tres o cuatro poblaciones de referencia. La etiqueta identifica la herramienta; sus combinaciones no identifican a padres, abuelos ni otros antepasados reales.

Utiliçalos juntos Quando você domine o processo: Monte Carlo para a leitura principal da mistura e Oracle para verificações hipotéticas estruturadas.

Glossário

As definições são deliberadamente breves. A ordem alfabética dos termos da interface original é preservada.

Admixture composition (Composição de mistura)
Pesos ajustados de populações de referência utilizados para reconstruir suas coordenadas dentro de uma calculadora.

Ancestry modeling (Modelos de ascendência)
Uso de coordenadas G25 y un panel de referencia para estimar contribuciones de tipo poblacional y resúmenes relacionados. No equivale a construir un árbol genealógico documental.

Ancestors Predictions
Análisis opcional que puntúa combinaciones poblacionales con proporciones fijas (consulta Monte Carlo e Oracle).

Calculator (Calculadora)
Painel de referência identificado e conjunto de ajustes utilizados para interpretar suas coordenadas.

Closest populations (Poblações mais próximas)
Poblações de referência com a menor distância genética às suas coordenadas no espaço G25 segundo o método escolhido.

Distance metric (Métrica de distância)
Regra matemática utilizada para medir a distância entre suas coordenadas e uma população de referência, como a eulídea.

Euclidean distance (Distância euclídea)
Distancia en línea recta en el espacio de 25 dimensiones. Una opción predeterminada habitual.

Fit escore (Puntuação de ajuste)
Resumo até que ponto as referências da calculadora reconstruem as suas coordenadas. Compara os resíduos dentro do mesmo método, painel e configuração; não há um intervalo universal que demonstre a precisão genealógica.

G25 coordenates (Coordenadas G25)
Vinte e cinco valores numéricos e uma marca de amostra que descrevem a sua posição no quadro Global25 do tipo PCA.

Genetic distance (Distância genética)
Separação entre dois conjuntos de coordenadas com a métrica escolhida. Uma distância menor costuma indicar maior semelhança segundo essa métrica.

Global25 (G25)
Sistema de 25 dimensões usado pelo G25 Studio e por ferramentas compatíveis.

Monte Carlo
Método iterativo de optimización que busca buenos ajustes de mezcla con la configuración elegida.

PCA (análise de componentes principais)
Visualização que projeta as coordenadas sobre os principais eixos de variação para observar sua proximidade a populações de referência.

Reference populations (Poblações de referência)
Promedios genéticos identificados, antiguos o modernos, que definen lo que puede modelar una calculadora.

Scaled coordenates (Coordenadas escaladas)
Coordenadas ponderadas por autovalores; la opción predeterminada habitual para modelos de tipo G25.

Unscaled coordenates (Coordenadas sem escalar)
Coordenadas na escala original do PCA; use-as quando o seu processo as exija expressamente.

Perguntas habituais ao começar

Por que vejo regiões das quais não tenho relatos familiares?
As populações de referência se sobrepõem e não seguem as fronteiras modernas. As proporções pequenas podem refletir padrões populacionais compartilhados, a escolha de referências ou incerteza do modelo. Um pequeno componente não estabelece um familiar recente ou uma conexão ancestral concreta.

Por que vocês discordam de duas calculadoras?
Cada calculadora utiliza un conjunto de referências diferentes. Referencias diferentes reparten tu genoma de forma distinta. Compáralas para identificar padrões robustos, no para elegir un único gráfico «verdadero».

G25 pode provar a minha etnia?
Não. É um marco de comparação estatística. A genealogia documental e as análises adequadas de genealogia genética têm finalidades distintas.

Solução de problemas

  • Formato de coordenadas inválido: confirma um nome e depois 25 números separados por vírgulas. Remove linhas vazias ou cabeçalhos adicionais.
  • Resultados inesperados ou instáveis: reduz o máximo das populações, teste o agrupamento e veja o alcance e cobertura de referência da calculadora. Não escolha um painel apenas para obter uma marca de identidade esperada.
  • Pontuação de ajuste alta: Verifica que o tipo escalado ou sem escalar é coerente, a métrica e a cobertura de referências. Compara alternativas dentro de seus limites declarados.
  • Tempo de cálculo longo: Desactiva gráficos opcionais complexos na primeira execução e limita as populações.

Próximos passos

Para mais orientação, leia as Perguntas frequentes sobre ascendência. Si un paso no está claro, Contate com DNA Genics.

Aviso

G25 Studio destina-se à educação e exploração de investigação. Não É um produto médico. Interpreta os resultados com cautela e evita afirmar mais do que permitem as percentagens modeladas sobre identidade ou história familiar.