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DNA GENICS / Les méthodes derrière le résultat

Comprendre la méthode.
Lire le résultat.

D'une estimation de composante à un segment partagé, chaque analyse répond à une question différente. Examinez ses entrées, sa sortie et ses limites avant de choisir votre prochaine étape.

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Que cherchez-vous
à comprendre\u00A0?

Un pourcentage, une position et un intervalle correspondant sont des types de preuves différents. Partez de la sortie que vous lisez.

  1. 01 / Composantes

    De quoi ce modèle est-il fait\u00A0?

    Les modèles par composantes estiment des motifs relatifs à un panel de référence.

    Lire les modèles par composantes
  2. 02 / Positions

    Quelles références sont proches\u00A0?

    Coordonnées, projections et distances décrivent la structure relative dans un espace défini.

    Lire les comparaisons par coordonnées
  3. 03 / Segments

    Où les marqueurs correspondent-ils\u00A0?

    Les méthodes de segments comparent des intervalles\u00A0; les estimations d'héritage exigent un contexte supplémentaire.

    Lire la preuve par segments partagés
  4. 04 / Lignées

    Quelle branche est prise en charge\u00A0?

    Les marqueurs Y-ADN et ADNmt offrent une perspective de lignée lorsque la couverture le permet.

    Lire l'analyse de lignée
  5. 05 / Préparation

    Qu'est-ce qui a été estimé\u00A0?

    Le phasage estime la disposition des allèles\u00A0; l'imputation estime des appels de génotype supplémentaires.

    Lire la préparation des données
Perspectives au niveau des populations

Modèles et comparaisons.

Identifiez l'espace de référence et le type d'estimation avant d'interpréter les chiffres.

ADMIXTURE et modèles par composantesQue représentent les composantes ?

Les modèles d'admixture basés sur les génotypes estiment comment la variation observée s'ajuste à un ensemble de composantes statistiques. K est le nombre de composantes. Changer K ou le panel de référence change la question ; un K plus élevé n'est pas automatiquement un meilleur ajustement.

Entrée
Marqueurs de génotype utilisables et données de référence du modèle.
Ce que cela montre
Estimations de composantes relatives à ce modèle. Les pondérations de mélange ajustées sur coordonnées sont un calcul distinct et nécessitent leur propre description de méthode.
Lire avec prudence
Une composante n'est pas une nationalité, une identité ni une fraction mesurée d'une population historique. Les petites estimations peuvent être sensibles au choix du modèle et au bruit.

La consultation du catalogue public est gratuite. L'analyse personnelle nécessite un échantillon traité adapté ; les collections exclusives ont un accès distinct.

Parcourir les calculateurs d'admixture
Illustrative modelComponents describe a fitted model.
InventedK5 model ABCDE
  • A: 30%
  • B: 24%
  • C: 20%
  • D: 16%
  • E: 10%

Invented values, not a personal result. Components depend on the model and its reference data.

G25 et représentations par coordonnéesQue puis-je comparer avec des coordonnées ?

Les coordonnées résument la variation dans un espace de référence particulier. Les lignes compatibles permettent distances, modèles de population ajustés et exploration visuelle. La génération de coordonnées DNA Genics produit des estimations de type G25 dérivées du modèle ; ce n'est pas une projection PCA directe du génotype dans l'espace d'un autre fournisseur.

Entrée
Pour les comparaisons : coordonnées compatibles, mise à l'échelle et espace de référence. La génération de coordonnées a ses propres exigences d'échantillon ADN.
Ce que cela montre
Une représentation numérique pour les outils qui acceptent ce format et cet espace.
Lire avec prudence
Le simple fait d'avoir le même nombre de colonnes n'établit pas la compatibilité. Les coordonnées ne sont pas des pourcentages, et mélanger des représentations peut rendre les distances trompeuses.

L'exploration G25 de base est gratuite avec des coordonnées adaptées. La génération de coordonnées et les méthodes PRO sont des capacités payantes distinctes lorsqu'elles sont proposées.

Voir la génération de coordonnées
Schematic reference spacePosition is a comparison, not a percentage.
Axis 1Axis 2 A B X
  • Circles: reference group A
  • Squares: reference group B
  • X: example point

Invented positions in a schematic space. Coordinates, scaling and reference space must be compatible.

Projections ACP et UMAPQue signifie une position sur un graphique ?

L'ACP représente des axes sélectionnés de variation génétique. Un échantillon peut être placé dans un espace de référence existant pour comparaison. UMAP est une autre méthode de réduction de dimensionnalité, avec ses propres paramètres et sa propre géométrie. Le rapport ou l'outil détermine quelle représentation est utilisée.

Entrée
Données de génotype ou de coordonnées compatibles et un panel de référence défini, selon l'outil concerné.
Ce que cela montre
Une vue de la structure relative dans les données, plutôt qu'une carte géographique.
Lire avec prudence
L'échantillonnage de référence, le prétraitement et les paramètres influent sur le graphique. La proximité visuelle n'est pas un lien familial calibré ni une preuve d'origine géographique.

À propos d'UMAP\u00A0: sa structure de voisinage et ses paramètres diffèrent de l'ACP. Des graphiques d'apparence similaire ne rendent pas leurs axes ou distances interchangeables. Une visualisation n'a pas à être une entrée du score d'un rapport.

Le Studio de base inclut des points d'entrée gratuits avec des entrées compatibles. Les visualisations avancées autonomes nécessitent l'accès PRO pertinent.

Parcourir G25 Studio
Analyse des haplogroupesQuelle branche de lignée est prise en charge ?

Des marqueurs sélectionnés du chromosome Y et de l'ADN mitochondrial peuvent soutenir une position sur un arbre de lignée paternelle ou maternelle. Une branche décrit une perspective de lignée, distincte d'une comparaison de population autosomique.

Entrée
Marqueurs informatifs Y-ADN ou ADNmt suffisants dans le fichier téléversé.
Ce que cela montre
Une branche de lignée partagée prise en charge à la résolution permise par les marqueurs.
Lire avec prudence
Une branche partagée n'identifie pas un ancêtre nommé précis, n'établit pas un lien familial récent ni ne décrit toute la similarité génétique d'une personne. La couverture peut limiter ou empêcher une prédiction.

L'accès aux rapports et la couverture des marqueurs sont des exigences distinctes. Consultez le produit et l'échantillon concernés avant d'acheter.

Parcourir les options de rapports
Selected shared lineage branchesOne branch gives one perspective.

Y-DNA

R-L151R-U106R-P312R-L21

mtDNA

HH1H3H5

Selected branches with intermediate branches omitted and no time scale. A shared lineage branch does not identify a specific named relative or summarize all genetic ancestry.

Chromosomes, marqueurs et préparation

Un regard plus attentif sur les données.

Ces méthodes portent sur la disposition des allèles, les marqueurs individuels et les intervalles chromosomiques. Les entrées requises varient selon le parcours.

Phasage ADNQuelles variantes appartiennent à la même copie ?

Le phasage estime comment les allèles observés sont disposés sur deux copies chromosomiques. Il peut préparer des données pour des analyses basées sur les haplotypes. Le phasage seul n'établit pas quelle copie est maternelle ou paternelle ; l'attribution du parent d'origine nécessite des informations supplémentaires.

Entrée
Données de génotype adaptées et entrées requises par la méthode de phasage.
Ce que cela montre
Haplotypes estimés : dispositions d'allèles sur les copies chromosomiques.
Lire avec prudence
La phase statistique peut contenir des erreurs. Une copie phasée n'est pas un génome parental mesuré, et les copies ne doivent pas être automatiquement étiquetées avec des noms de parents.

Une capacité de traitement distincte lorsqu'elle est disponible. Consultez les exigences de fichier, la portée achetée et l'accès existant.

Voir le service de phasage
Schematic phasingEstimate the two chromosome copies.
ObservedA/GC/T Copy 1Copy 2ACGT

One invented phase assignment. Statistical phasing does not by itself label the copies as maternal and paternal; additional information is needed.

Inférence d'ancrage localComment les attributions varient-elles le long d'un chromosome ?

L'inférence d'ancrage local attribue des intervalles chromosomiques à des composantes de référence statistiques. Une peinture chromosomique montre des attributions basées sur le modèle le long d'un chromosome, en complément d'un résumé de l'échantillon entier.

Entrée
Données au niveau chromosome compatibles, panels de référence et préparation requise par l'implémentation sélectionnée.
Ce que cela montre
Attributions dépendantes de la référence le long d'intervalles génomiques.
Lire avec prudence
Les couleurs représentent des composantes du modèle, pas des origines géographiques vérifiées pour chaque intervalle. Des groupes de référence proches peuvent être difficiles à distinguer.

Les méthodes dépendent du rapport ou de l'outil. Ce guide ne promet pas que chaque calculateur fournit une inférence d'ancrage local.

Parcourir les options d'analyse par composantes
Segments partagés : IBS et IBDQue soutient un segment correspondant ?

L'identité par état (IBS) décrit la correspondance d'allèles observés sur les marqueurs comparés. L'identité par descendance (IBD) décrit un segment hérité via une source ancestrale partagée. L'IBD est inféré à partir des données et des hypothèses ; une correspondance de marqueurs seule ne le prouve pas.

Entrée
Données de marqueurs comparables, couverture adaptée et seuils de qualité de la méthode de segment. Une exportation de correspondances est distincte d'un fichier de génotype RAW.
Ce que cela montre
Preuve de marqueurs ou de segments partagés, avec estimations de lien lorsque c'est pris en charge.
Lire avec prudence
Des correspondances courtes ou clairsemées peuvent survenir par hasard ou via l'histoire des populations. Longueur, densité de marqueurs, phasage et hypothèses influent sur la confiance ; une correspondance ne prouve pas un lien familial nommé.
L'IBD est une inférence. La preuve d'héritage partagé dépend de la méthode, de ses seuils et de la qualité des données.

Un navigateur chromosomique affiche les intervalles correspondants rapportés par la méthode sélectionnée. L'affichage lui-même n'établit ni l'héritage ni un lien familial.

L'analyseur de correspondances actuel est gratuit avec une exportation de correspondances prise en charge et utilise un traitement serveur. Les autres parcours de segments ont leurs propres exigences.

Parcourir DNA Matches Analyzer
Illustrative marker comparisonA matching call is evidence to interpret.
AB ACGTACAT

Invented calls at four positions. IBS concerns matching observed alleles; inferring IBD needs additional segment and statistical evidence.

Comparaison SNP avec des génomes archaïquesQue compte un score de similarité archaïque ?

Les rapports de comparaison Néandertal et Dénisova comparent les variantes SNP observées aux génomes de référence archaïques. Leur similarité basée sur le dénombrement concerne les positions testées et les comparaisons de référence, plutôt qu'un graphique de coordonnées.

Entrée
Positions génotypées utilisables qui recoupent les données de référence archaïques du rapport.
Ce que cela montre
Variantes testées correspondantes par rapport aux positions comparées.
Lire avec prudence
Ce n'est pas un pourcentage directement mesuré de génome archaïque. La couverture, la sélection de référence et la variation humaine partagée influent sur la comparaison.

Ces produits de rapport ont leurs propres exigences d'accès et de couverture. Le téléversement seul n'ouvre pas les rapports payants.

Parcourir les rapports de référence archaïques
Imputation de génotypesComment les positions non testées sont-elles estimées ?

L'imputation utilise les marqueurs observés et les motifs d'haplotypes de référence pour estimer des génotypes probables à des positions supplémentaires. Elle fournit des estimations statistiques pour des parcours en aval adaptés, avec une confiance variable selon les positions et la couverture de référence.

Entrée
Un fichier de génotype compatible avec des marqueurs utilisables et un panel de référence adapté.
Ce que cela montre
Appels de génotype supplémentaires estimés et sorties spécifiées par le service.
Lire avec prudence
Un appel imputé n'est pas une nouvelle mesure ni une lecture de séquençage. Davantage de marqueurs estimés ne garantit pas un résultat en aval plus précis.

Une capacité de traitement distincte lorsqu'elle est disponible. Consultez l'entrée prise en charge, les formats de sortie et la portée achetée.

Voir l'imputation ADN
Schematic imputationEstimated calls remain estimates.
InputOutput AA?GGAAEstimateGG

Invented positions. Reference-based estimation can add likely genotypes at untested positions; it does not add laboratory measurements.

Lire correctement la sortie

Trois nombres.
Des sens différents.

Vérifiez le libellé et le calcul avant de comparer deux résultats.

Une distance
Similarité relative selon un calcul particulier. Plus petit signifie plus proche dans cette comparaison, avec entrée et mise à l'échelle compatibles. Les distances ne sont ni des pourcentages ni des probabilités de lien.
Une composante ou pondération ajustée
Une estimation dans un modèle spécifié. Les estimations par composantes basées sur le génotype et les pondérations ajustées sur coordonnées sont des calculs distincts, même lorsque les deux apparaissent en pourcentages.
Une coordonnée
Une position dans une représentation particulière. L'espace de référence, le format et la mise à l'échelle comptent\u00A0; les coordonnées ne sont pas des emplacements géographiques.
La référence fait partie du résultat

Chaque comparaison
a besoin de contexte.

Les panels modernes, échantillons anciens et références propres à chaque méthode répondent à des questions différentes. La couverture varie selon les populations, régions et périodes.

Parcourir les panels de référence des calculateurs

Avant de comparer des résultats

  1. Vérifiez le panel de référence.Qui est représenté, et ce qui manque\u00A0?
  2. Vérifiez l'entrée utilisable.Quels marqueurs, intervalles ou représentation par coordonnées ont été comparés\u00A0?
  3. Vérifiez les hypothèses.Quels paramètres, préparation et seuils de qualité façonnent la sortie\u00A0?
  4. Vérifiez la version et l'objectif.Une mise à jour du modèle peut changer les estimations. Une autre question peut exiger une autre méthode.
Interprétation et limites

Gardez les éléments de preuve
en perspective.

Les résultats décrivent une similarité génétique ou des estimations statistiques. Ils n'établissent pas l'ethnicité, la nationalité, l'identité culturelle ni un lien familial nommé.

Couverture de référence

Une comparaison absente compte.

Une population ou période sous-représentée peut influencer le positionnement d'un échantillon. Un chiffre d'apparence précise n'efface pas cette incertitude.

Sensibilité du modèle

Une petite estimation exige du contexte.

Marqueurs, références et paramètres sélectionnés peuvent modifier les estimations. Plusieurs sorties similaires ne constituent pas automatiquement des preuves indépendantes.

Objectif

Utilisez la question prévue.

Ces rapports et outils soutiennent une exploration éducative. Ce ne sont pas des diagnostics cliniques, des preuves juridiques ni un substitut à une généalogie documentée.

Une habitude de lecture utile

Lisez la méthodologie et les limites du rapport, comparez des sorties compatibles, conservez le contexte de référence et recourez à des preuves supplémentaires adaptées aux questions que le modèle ne peut pas trancher.

Consulter les questions sur la similarité génétique
Choisir un parcours

Mettez le guide
en pratique.

Partez de votre question et de vos données existantes. Outils gratuits, rapports, préparation des données et méthodes avancées ont des exigences distinctes.

Utilisez les données que vous avez

Parcourir le Studio.

Comparez les parcours G25 gratuits, les outils locaux sur fichier RAW et l'analyse de correspondances. Des coordonnées adaptées peuvent être réutilisées sans racheter la génération.

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Préparer un échantillon sur le site

Commencez par votre fichier ADN.

Vérifiez compatibilité, traitement et consentement. Le téléversement lance le parcours d'échantillon\u00A0; rapports payants et capacités restent des choix distincts.

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Comparer l'accès premium.

Consultez les collections actuelles, la portée d'échantillon et les options limitées dans le temps. Vérifiez l'accès existant et le détail de chaque produit avant d'acheter.

Comparer les offres
Aller plus loin

Lire sur
les méthodes.

La recherche primaire et la documentation des méthodes fournissent du contexte. Ces liens n'impliquent pas que chaque rapport utilise le logiciel cité ni que ses auteurs approuvent DNA Genics.

  1. Documentation de l'auteur d'ADMIXTUREComposantes, K et sélection de modèle.
  2. McVean\u00A0: A Genealogical Interpretation of Principal Components AnalysisÉchantillonnage et limites de l'interprétation démographique.
  3. PLINK\u00A0: estimation IBS et IBDMarqueurs comparés, estimations et hypothèses.
  4. Glossaire de la méthode SHAPEITHaplotypes, phasage et imputation.
Avant votre prochaine étape

De bonnes questions.
Une interprétation plus claire.

Comprenez le calcul et l'entrée avant de choisir un rapport ou un outil.

Aperçu de rapports d'exemple (en anglais)
Tous les rapports utilisent-ils G25 ?

Non. Les rapports emploient différentes combinaisons de modèles par composantes basés sur les génotypes, projections, comparaisons de marqueurs, méthodes de segments et analyses de lignée. Lisez la description de méthode du rapport concerné. G25 est un parcours basé sur les coordonnées, pas une explication universelle de chaque résultat.

Pourquoi deux modèles donnent-ils des pourcentages différents ?

Les références, marqueurs sélectionnés, hypothèses et nombres de composantes peuvent différer. Les pondérations de mélange ajustées sur coordonnées et les estimations ADMIXTURE basées sur les génotypes sont aussi des calculs distincts. Comparez les sorties avec leur méthode et leur contexte de référence.

Une distance plus petite est-elle toujours meilleure ?

Une distance plus petite signifie une similarité plus proche selon ce calcul, à condition que les données, la mise à l'échelle et l'espace de référence soient compatibles. Ce n'est pas un pourcentage de similarité génétique, une probabilité de lien ni une preuve d'origine géographique.

Le phasage identifie-t-il l'ADN de mes parents ?

Le phasage estime la disposition des allèles sur les copies chromosomiques. Il n'établit pas à lui seul quelle copie est maternelle ou paternelle ; l'étiquetage du parent d'origine nécessite des informations supplémentaires. La phase statistique peut contenir des erreurs.

Quelle est la différence entre IBS et IBD ?

L'IBS décrit la correspondance d'allèles observés sur les marqueurs comparés. L'IBD décrit un héritage partagé et est inféré à partir des données et des hypothèses. Une correspondance courte ou clairsemée seule ne prouve pas un ancêtre partagé particulier ni un lien familial.

Les illustrations sont-elles mes résultats ?

Non. Les valeurs de composantes, positions, correspondances de marqueurs et appels estimés sont des exemples schématiques inventés. Les arbres de lignée montrent des branches sélectionnées, avec des branches intermédiaires omises et sans échelle temporelle.

Téléverser équivaut-il à acheter un accès ?

Non. Le téléversement démarre le parcours d'échantillon et peut fournir les rapports gratuits disponibles. Les produits de rapport, la génération de coordonnées, les outils PRO avancés et l'accès IA ont leurs propres exigences et conditions. Vérifiez l'accès existant avant d'acheter.

Par où commencer ?

Utilisez le Studio pour choisir un parcours selon votre objectif et vos données existantes. Avec un fichier RAW ADN compatible, consultez les options de téléversement. Avec des coordonnées G25 adaptées, parcourez le parcours de comparaison de base gratuit. Les offres groupées et guides produits expliquent les options payantes.

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Nous analysons l’ADN ancien et moderne depuis 2018

DNA Genics élabore des rapports de similarité génétique et d’analyse ADN depuis 2018. Nos rapports reposent sur des années de travail avec nos propres panneaux de référence, calculateurs et comparaisons à des génomes anciens, développés et revus par notre équipe. Ils ne sont pas générés à la volée ni assemblés comme projet annexe. Nous n’utilisons l’IA que dans des fonctionnalités optionnelles clairement identifiées.

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